Seit dem Jahr 1988 praktiziert Anita Wysser die Zen-Meditation und lässt sich vom japanischen Zen-Meister Yamakawa Sogen Roshi unterweisen, der jedes Jahr einmal ein Zen-Sesshin in der Schweiz gibt. Sie besuchte sein Kloster, das Shogen-ji Kloster in Japan, wo sie im Jahr 2011 eingeladen ist, an Kulturtagen des Klosters Konzerte zu geben.

In Biel hat sie mit Freunden zusammen ein kleines Zendo (Meditationsraum) eingerichtet. Ein Raum der Stille.

Sie verbindet die Meditation auch mit Musik. So gibt sie zum Abschluss von jedem Zen-Sesshin ein Konzert oder tritt an entsprechenden Veranstaltungen mit Gong und Flöte unter dem Titel "Anahata" auf.